Ich habe ein großartiges Tool gefunden, mit dem sich der npm-Abhängigkeitsgraph visualisieren lässt.
Dieses Beispiel zeigt den Abhängigkeitsgraphen von react-native-maps, den ich mir gestern Abend angesehen habe.
https://npm.anvaka.com/#/view/2d/react-native-maps
2D

Man kann Knoten verschieben und sie per Mouseover hervorheben.
3D

Man kann den Graphen drehen, allerdings zeigt die 3D-Ansicht keine Modulnamen an.